Ильинский Замошский погост в Бегуницах с церковью Ильи Пророка упоминается в писцовой книге Водской пятины 1499/1500 г. Многочисленные археологические памятники свидетельствуют о том, что славяне пришли на эти земли ещё раньше, в XI – XII вв.
Деревянная Ильинская церковь в Бегуницах была сооружена в 1737 году владельцем села А.М. Голицыным. Около 1822 г. она сгорела. На её месте в 1831 году владельцем соседнего имения Ивановское А. И. Рамбургом была построена церковь Михаила Архангела. В конце XIX в. внук А.И. Рамбурга Н.Н. Велио, последний владелец имения, построил по проекту В. Фриделли колокольню. У храма похоронены помещики окрестных деревень Рамбурги, Велио и другие.
Строение каменное в стиле классицизма, сохранилось до наших дней, хотя и использовалось с 1930 года после закрытия церкви сначала под деревенский клуб, а потом под тракторные мастерские. Когда в 90-х годах здание храма вернули церкви, то сначала отремонтировали трапезную, где стали проводить службы. Вновь освящен в 1996 году. Находится на 75 км. Нарвской трассы, приглашая путника зайти и помолиться перед дальней дорогой. Службы идут регулярно.